Biopython,
本节介绍如何在您的计算机上安装Biopython。它非常容易安装,不到五分钟就能安装完毕。
步骤1验证Python安装
Biopython旨在与Python 2.5或更高版本一起使用。所以必须先安装python。在命令提示符下运行以下命令:
python版本
如下所示:
如果安装正确,它将显示python的版本。否则,请下载最新版本的python,安装它,然后再次运行该命令。
步骤2使用pip安装Biopython
Biopython可以在所有平台上使用pip从命令行轻松安装。键入以下命令
pip安装biopython
以下结果将显示在屏幕上
要更新Biopython的旧版本,请键入以下命令
pip安装biopython --升级
屏幕上将显示以下响应
执行此命令后,在安装最新版本之前,将会删除旧版本的Biopython和NumPy(取决于Biopython)。
步骤3验证Biopython安装
现在,您已经成功地在计算机上安装了Biopython。要验证Biopython安装是否正确,请在python控制台上键入以下命令
它展示了Biopython的版本。
替代方法——使用源代码安装Biopython
要使用源代码安装Biopython,请遵循以下说明-
从以下链接下载Biopython的最新版本
到目前为止,最新版本是biopython-1.72。下载文件并解压缩压缩的归档文件,移动到源文件夹并键入以下命令:
python setup.py build
它将从下面给出的源代码构建BioPython
现在,使用下面的命令来测试代码
python setup.py测试
最后,使用以下命令安装-
python setup.py安装
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