什么是反向重复序列,反向重复序列和正向重复序列

　　关键词：反向；完整；测序；

　　*如何获得基因序列的反向互补序列？*这是基因序列分析领域的常见问题。其实答案很简单。很多现成的软件都有这个功能。但是，作为一个活着的信徒，当然可以自己实现一个。

　　首先想到的是用* *多个if…else…**语句判断选择的方法。这种方法太笨拙了，写出来的代码很难看。今天分享几个好方法。

　　版本：tr和shell命令

　　Python版本：基于字典

　　代码如下所示。

　　这种方法简短，美观，一目了然。上面的代码只需要遍历一次原字符串，而且比使用多个str.replace()函数效率更高，因为多个str.replace()函数需要多次遍历字符串。

　　此外，在上面的代码中，字符串被用来编写Pythonic。s[:-1].更多的Pythonic语法请参考我的拙作《Python（一）让你的代码更加pythonic》。

　　c:基于数组

　　代码如下所示。

　　这种方法可以通过使用字符的ascii码将字符映射到数字。这个数字被转换成字符数组的编号(索引)，完成了字符到字符的映射。C的版本是目前最快的！

　　值得注意的是，上述编码序列不仅可以完成最常见碱基“AGCTN”之间的映射，还可以完成“B”和“V”、“D”和“H”、“R”和“Y”等http://www.Sina.com

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